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GS-GelRed 核酸凝膠染料(10,000×)是一種安全、靈敏、穩(wěn)定的熒光核酸凝膠染色試劑,適用于瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠上的dsDNA、ssDNA和RNA染色,經(jīng)過本產(chǎn)品染色的DNA條帶在紫外光投射下呈現(xiàn)紅色熒光,可以替代溴化乙錠(EtBr)。艾姆斯氏試驗結(jié)果也表明,該染料的誘變性遠遠小于溴化乙錠(EtBr),使用更加安全。
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? 安全無毒:GS-GelRed的油性和大分子量特點使其不能穿透細胞膜進入細胞內(nèi);
? 靈敏度高:適用于各種分子量DNA電泳,對于微量的DNA具有更高的檢測靈敏度;
? 信噪比高:樣品熒光信號強,背景信號低;
? 適用范圍廣:膠染法(電泳前染色)和泡染法(電泳后染色)均可;適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于dsDNA、ssDNA和RNA染色。
產(chǎn)品簡介
GS-GelRed 核酸凝膠染料(10,000×)是一種安全、靈敏、穩(wěn)定的熒光核酸凝膠染色試劑,適用于瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠上的dsDNA、ssDNA和RNA染色,經(jīng)過本產(chǎn)品染色的DNA條帶在紫外光投射下呈現(xiàn)紅色熒光,可以替代溴化乙錠(EtBr)。艾姆斯氏試驗結(jié)果也表明,該染料的誘變性遠遠小于溴化乙錠(EtBr),使用更加安全。
GS-GelRed和EB具有相同的光譜特性,不需要更換成像系統(tǒng),使用與觀察EB相同的普通紫外凝膠透射儀觀察即可,在300 nm紫外光附近可得到最佳激發(fā)。注意GS-GelRed不能被488 nm氬離子激光器(如藍光透射儀)或相似波長的可見光wan全激發(fā),因此不推薦使用此類激發(fā)裝置的成像系統(tǒng)。
適用范圍
適用于瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠上的 dsDNA、ssDNA 和 RNA 染色。
注意事項
1. 染料無需低溫冷藏,請于室溫下避光儲存,避免沉淀。若出現(xiàn)沉淀,請將染料置于 45~50℃ 2 min,振蕩使充分溶解后再使用;
2. 由于 GS-GelRed 的高靈敏性,建議減少 DNA 樣品上樣量,推薦已知濃度樣品的上樣量為50~200 ng/泳道;
3. 聚丙烯酰胺凝膠電泳請使用泡染法。
使用方法
一、膠染法(電泳前染色,用法同 EB)
1. 配制合適濃度的瓊脂糖凝膠;
2. 用微波爐加熱使瓊脂糖wan全融化;
3. 加入 GS-GelRed 使其終濃度為 1× (即 100 mL 凝膠中加入 10 μL GS-GelRed 10,000×水溶液),此時溶液呈淡粉色;
4. 將含有 1×GS-GelRed 染液的瓊脂糖溶液倒入膠槽中,插入齒梳,室溫凝固;
5. 按照常規(guī)方法進行電泳;
6. 用 302 nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。
二.泡染法 (電泳后染色)
1. 按照常規(guī)方法進行電泳;
2. 使用 0.1 M NaCl 溶液稀釋 GS-GelRed 染液至 3×染色液(例如將 15 μL GS-GelRed 10,000×水溶液加入 50 mL 0.1 M NaCl 溶液中);
3. 將凝膠小心地放入合適的容器中,緩慢加入足量的 3×染色液浸沒凝膠,室溫搖床孵育 30 min(對于含 3.5~10%丙烯酰胺的聚丙烯酰胺凝膠,需孵育 30 min~1 h,時間隨著丙烯酰胺含量增加而延長。單次使用的 3×染色液可重復(fù)使用 3 次左右,室溫避光保存);
4. 用 302 nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。
GS-GelRed 核酸凝膠染料(10,000×)常見問題與解決辦法
Q1:使用膠染法,出現(xiàn) DNA 條帶彌散、拖尾或彎曲等現(xiàn)象?
A1:
1) 確保使用的染料終濃度為 1×;
2) DNA 上樣量過多。將 DNA 樣品上樣量減少至 1/3 或 1/5;
3) 凝膠濃度不合適。檢測大片段 DNA 建議使用低濃度瓊脂糖凝膠;
4) 樣品中 loading buffer 過量。loading buffer 中的 SDS 可能會影響電泳效果,建議減少 loadingbuffer 用量;
5) 使用合適的電壓,建議 5~10 V/cm;
6) 使用新鮮的電泳緩沖液。
Q2:使用膠染法發(fā)現(xiàn) DNA 遷移率存在差異?
A2:
1) 將 DNA 樣品上樣量減少至 1/3 或 1/5;
2) GS-GelRed 分子量較大,大分子量導(dǎo)致 DNA 的遷移速率可能受到染料與 DNA 比率的影響。因此不建議將 GS-GelRed 直接添加到 loading buffer 中使用,這會導(dǎo)致條帶遷移不準(zhǔn)確;
3) 可使用泡染法準(zhǔn)確確定 DNA 條帶大小。
Q3:ssDNA 和 RNA 染色效果不如 dsDNA?
A3:GS-GelRed 對于 dsDNA 的靈敏度是 ssDNA 或 RNA 的 5 倍,可適當(dāng)提高 ssDNA 或 RNA 上樣量。